Для проведения некоторых видов МРТ трубуется специальная подготовка, чтобы минимизировать помехи и получить высококачественное изображение органов и тканей.
Подготовка необходима для МРТ таких областей как:

• Печень
• Поджелудочная железа
• Желчный пузырь
• Селезёнка
• Брюшная полость
• Почки
• Надпочечники
• Забрюшинное пространство
• Органы малого таза (женского и мужского)
• Молочные железы

Специальная подготовка для данных областей состоит состоит из нескольких ключевых моментов:
Диета и режим питания:

• Приходить желательно утром натощак. Последний приём пищи должен быть минимум за 6-8 часов
• За день до исследования не следует есть продукты с содержанием грубой клетчатки (например, капуста и другие овощи и фрукты, чернослив, чёрный хлеб, кисломолочные продукты газированные напитки);

Приём лекарств:

• С вечера: активированный уголь (2 таблетки на 10 кг веса) или «Эспумизан». Нужно для снижение степени газообразования
• За 30-40 минут до исследования: 1-2 таблетки «Но-шпа»

Специальная подготовка для женщин:

• МРТ органов малого таза и молочных желёз рекомендуется проводить на 6–12 день менструального цикла; во время менструации обследование не выполняется.

Одежда и украшения:

• Рекомендуется надевать свободную и удобную одежду без металлических элементов. Любые металлические предметы следует оставить за пределами кабинета, потому что они могут повлиять на изображение.

Пациентам желательно брать с собой медицинскую документацию (предыдущие заключения МРТ, УЗИ, КТ, выписки после оперативных вмешательств и, если имеется, направление от врача), относящуюся к обследуемой зоне, чтобы врач мог заранее продумать ход исследования.